中大新聞網廣州11月16日電（通訊員李鍶鐸、熊麗娜）近日，2022國際基因工程機器大賽(International Genetically Engineered Machine Competition, iGEM)落下帷幕。我校生命科學學院兩支本科生參賽隊伍，憑借嚴謹的實驗結果、流暢的線上演講答辯和生動有趣的視頻展示得到大賽評委專家的認可，其中SYSU-Software斬獲金牌，SYSU-CHINA收獲銀牌，再次在國際舞臺上展現中大學子的風采。
本次比賽共有來自麻省理工學院、耶魯大學、哈佛大學、清華大學、北京大學、中山大學等國內外知名學府共350支隊伍參賽。由于疫情影響，比賽于10月26日至28日以法國巴黎現場和遠程線上結合的模式舉行。
中山大學軟件隊（SYSU-Software）成員包括來自生命科學學院的李鍶鐸、王元瑾、陳佳芃、程一諾、馮瑜輝、李慧彬、李凱、童馨潔、伍周穎、張藹銘，計算機學院的黃靖云、王童、許鴻鑫、許遵楠、楊天行、鄭中淳，數學學院的龔立言，傳播與設計學院的簡子喬，生態學院的徐微，環境科學與工程學院的李心妍、邱文君等，不同學科背景的同學聚在一起激起創新思維的火花。在生命科學學院楊建華教授等老師的指導下，團隊閱讀大量文獻，走訪不同實驗室，抓住尋找原核生物新型的抗病毒基因的學術前沿話題，充分運用合成生物學的思維方式和研究手段，結合大數據、人工智能算法和機器學習等開發出原核生物抗性系統搜索及預測平臺“LOUPE”（http://sysu-software.com），主要目標是從巨大的微生物基因組中發現新的防御系統及防御基因。應用“LOUPE”軟件于大規模的微生物基因組數據中，挖掘出大批新的防御基因，最后利用濕實驗初步驗證了這些基因的潛在防御功能。該項目為研究者尋找潛在基因編輯工具和理解噬菌體-宿主相互競爭機制提供了新的方法。
SYSU-Software今年項目LOUPE的Wiki主頁
https://2022.igem.wiki/sysu-software/
LOUPE 軟件的工作流程圖
中山大學實驗隊（SYSU-CHINA）的成員包括來自生命科學學院的曾旭明、鄔雅萱、凌嘉駿、周琪皓、邊靖元、羅珺文、陳一博、何欣樂、田嘉源、王志威、王泓戈、孫華為，藥學院的鄭嘉怡和中山醫學院的趙樂容。在劉建忠教授的指導下，團隊成員分工合作，通過合成生物學方法，致力于應用微生物共催化工程的紅景天苷合成。在接近一年的比賽過程中，團隊從實驗設計出發，先后完成了工程驗證（Engineering success）和概念驗證（Proof of concept）等內容，并通過Alphafold2預測蛋白質結構，輔以分子動力學模擬，酶動力學模擬等分析方法為濕實驗提供幫助。團隊的工作為酪氨酸衍生物的合成與共催化工程的應用積累了寶貴的經驗。
SYSU-CHINA今年項目ACCESS的Wiki主頁
https://2022.igem.wiki/sysu-china/
項目相關的分子對接與分子動力學模擬實驗
本次賽事得到學校國際合作與交流處、教務部、團隊師生所在學院等單位的大力支持和廣東省人民醫院檢驗科的幫助。中大軟件隊自2012年參賽以來，八次獲得大賽金獎，其中四次問鼎全球軟件項目組世界冠軍(Best Software)，還曾獲得過最佳應用設計獎提名和最佳數學建模獎提名，是全球軟件項目組中獲得冠軍次數最多的一支隊伍。中大實驗隊自2011年參賽以來，七次獲得大賽金獎，三次獲得銀獎，曾獲得Best New Biobrick Part、Best New Composite Part、Best Model等單項大獎，曾在全球決賽中位列世界第二。
文稿終審：生命科學學院 張斯虹
