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中山大學李陳龍團隊揭示植物BCL7A/B亞基增強SWI/SNF復合體介導的染色質可及性進而調控基因表達和營養生長階段轉換的分子機理

稿件來源:生命科學學院 編輯:盧旖維 審核:孫耀斌 發布日期:2024-02-22 閱讀量:

中山大學新聞網訊(通訊員熊麗娜)SWI/SNF(Switch/Sucrose Non-Fermenting)復合體是一個進化上保守的ATP依賴型染色質重塑復合體,通過調整染色質結構來控制染色質的可及性及基因的表達。然而,在真核生物中,SWI/SNF復合體的重塑活性如何被調節仍然難以捉摸。雖然人們在十多年前已經發現B-cell lymphoma/leukemia 7A/B/C(BCL7A/B/C)蛋白是哺乳動物SWI/SNF(mSWI/SNF)復合體的亞基,其植物中的同源亞基也在最近的研究中得到了確認,但BCL7亞基在真核生物SWI/SNF復合體中的具體功能仍然未知。

2024年1月31日,中山大學李陳龍課題組在著名學術期刊Nature Communications發表題為“BCL7A and BCL7B potentiate SWI/SNF-complex-mediated chromatin accessibility to regulate gene expression and vegetative phase transition in plants”的研究論文。該研究首次發現了能夠特異性強化真核生物SWI/SNF復合體的染色質重塑活性的亞基,并解析了其調控染色質可及性來維持植物幼年期身份的機制。

BCL7A/B通過促進SWI/SNF介導的染色質可及性促進植物幼年期身份的維持

植物的SWI/SNF復合體可分為三類,分別是BAS復合體(BRM-Associated SWI/SNF complex)、SAS復合體(SYD-Associated SWI/SNF complex)、和MAS復合體(MINU-Associated SWI/SNF complex)。在這項研究中,研究人員通過ChIP-seq和RNA-seq展示了擬南芥中的BCL7A/B作為SWI/SNF復合體的成員,具有與核心亞基BRM類似的全基因組結合模式和基因調控能力。ATAC-seq發現BCL7A/B是SWI/SNF維持基因組范圍染色質可及性所必需的亞基。一方面,BCL7A/B依賴與BRM亞基的直接蛋白互作來整合裝配到BAS復合體中;另一方面,BCL7A/B在大量靶基因上的結合也依賴BRM。不同于以往研究中的其它BAS復合體亞基(如BRIP1/2, BRD1/2/13等),BCL7A/B缺失后,BAS復合體仍然正常組裝并與目標染色質結合,但是該殘缺的復合體卻無法維持基因組范圍的染色質可及性。因此,BCL7A/B特異性調控染色質可及性但不調節BAS復合體的組裝及基因組靶向性,表明它們能夠特異性強化真核生物SWI/SNF復合體的染色質重塑活性。研究人員進一步證明了BCL7A/B與BRM相互依賴地在MIR156A/C的幼年期重置區(JRR)產生開放的染色質,從而保持幼苗中MIR156A/C的高水平表達,維持植物的幼年期身份,以防止植物過早地向成熟期轉變。

綜上所述,本研究結果揭示了之前難以捉摸的BCL7A/B亞基的獨特功能。BCL7A/B具有微調SWI/SNF復合體的重塑活性,增強SWI/SNF復合體產生染色質可及性的功能。這些結果為理解動物中BCL7蛋白在SWI/SFN復合體中的功能提供了新的思路,也為理解植物如何阻止幼年期過早轉變為成熟期提供了重要的理論參考。

中山大學李陳龍教授為該論文的唯一通訊作者,課題組已出站博士后雷亞文(現工作于廣東省科學院南繁種業研究所)和博士后俞堯光為共同第一作者,福建農林大學呂培濤教授也參與了該項研究。同時浙江農林大學的吳剛教授提供了spl9-4 spl15-1, p35S:MIM156和pMIR156A:GUS材料,中山大學肖仕教授提供了原核表達載體。中山大學生命科學學院為第一作者單位。該研究得到了國家自然科學基金,中國博士后科學基金,廣東省基礎與應用基礎研究聯合基金以及中央高?;究蒲袠I務費的資助。

論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-024-45250-x

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